More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4538 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
228 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
188 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
193 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
191 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
186 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
186 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
186 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
207 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
207 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
207 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
207 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
210 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
207 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
186 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
186 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
191 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.5 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
185 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 
189 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
184 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 
196 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
186 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
186 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
180 aa  148  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 
191 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
189 aa  148  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
188 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
187 aa  145  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
199 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
193 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 
189 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
189 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 
206 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  43.28 
 
 
213 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.27 
 
 
195 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
181 aa  139  3e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
183 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
185 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
189 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 
190 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
185 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  40.96 
 
 
189 aa  135  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  41.07 
 
 
188 aa  134  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
190 aa  134  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  36.7 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 
191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
190 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
191 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
209 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
186 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
190 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
186 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
192 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
189 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.28 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.62 
 
 
210 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  38.31 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
190 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
193 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  35.94 
 
 
199 aa  124  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
191 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  38.31 
 
 
202 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
196 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>