More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4505 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  100 
 
 
81 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  77.92 
 
 
77 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  77.92 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  73.42 
 
 
79 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  76.62 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  72.15 
 
 
79 aa  116  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  72.37 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  72.37 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  72.37 
 
 
77 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  71.79 
 
 
78 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  69.62 
 
 
79 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  70.13 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  73.42 
 
 
79 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  72.37 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  71.79 
 
 
79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  70.51 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  70.51 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  76.71 
 
 
79 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  69.23 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  79.45 
 
 
77 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  66.67 
 
 
79 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  70.13 
 
 
77 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  73.24 
 
 
73 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  68.83 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  69.74 
 
 
78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  68.83 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  68.83 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  71.05 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  72.6 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  68.83 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  69.74 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  72 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  65.38 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  72 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  69.74 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  69.23 
 
 
78 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  69.23 
 
 
78 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  69.74 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  69.74 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  77.78 
 
 
80 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  70.27 
 
 
80 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  68.42 
 
 
82 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  68.42 
 
 
82 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  69.23 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  69.23 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  67.09 
 
 
79 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  67.95 
 
 
78 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  68.42 
 
 
77 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  67.95 
 
 
78 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  67.95 
 
 
78 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  65.82 
 
 
79 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  67.95 
 
 
78 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  70.27 
 
 
76 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  67.53 
 
 
80 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  64.56 
 
 
79 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  67.53 
 
 
77 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  68.42 
 
 
77 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  68.42 
 
 
78 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  67.09 
 
 
79 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  69.86 
 
 
78 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  64.56 
 
 
79 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  68.42 
 
 
78 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  62.82 
 
 
78 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>