More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4487 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  100 
 
 
304 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  59.22 
 
 
321 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  58.33 
 
 
298 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  56.77 
 
 
303 aa  359  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  56.77 
 
 
303 aa  359  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  58.64 
 
 
301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  57.09 
 
 
308 aa  341  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  60.07 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  57.8 
 
 
306 aa  334  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  54.11 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  55.94 
 
 
298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  322  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  55.12 
 
 
298 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  54.42 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  54.77 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.19 
 
 
329 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  51.19 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  51.19 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  51.19 
 
 
329 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  51.71 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.85 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.85 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  51.19 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.85 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.85 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  51.37 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  51.9 
 
 
337 aa  311  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.85 
 
 
330 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.85 
 
 
330 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  54.32 
 
 
324 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  51.19 
 
 
335 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  51.25 
 
 
327 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.05 
 
 
309 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  51.45 
 
 
299 aa  310  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  51.19 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  53.93 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.06 
 
 
318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.51 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.51 
 
 
330 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.51 
 
 
330 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.51 
 
 
330 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  55 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  50.53 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  49.29 
 
 
290 aa  308  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  49.66 
 
 
332 aa  308  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52.31 
 
 
282 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  49.82 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  54.84 
 
 
298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50.51 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  49.15 
 
 
332 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.15 
 
 
298 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  49.29 
 
 
338 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  52.33 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  49.15 
 
 
326 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50.53 
 
 
339 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50.53 
 
 
318 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  49.15 
 
 
326 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  49.15 
 
 
326 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  50 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.95 
 
 
340 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  52.33 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  51.58 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  51.42 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  49.47 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  52.54 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  47.46 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  49.1 
 
 
288 aa  302  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  49.13 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  51.61 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  51.61 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  47.46 
 
 
323 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  51.96 
 
 
321 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.72 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  51.59 
 
 
321 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  48.97 
 
 
333 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  48.97 
 
 
333 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  50.53 
 
 
320 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.11 
 
 
325 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  52.77 
 
 
280 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  51.24 
 
 
321 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  49.66 
 
 
331 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>