More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4478 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  807    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  44.09 
 
 
403 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  47.49 
 
 
383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 
403 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.87 
 
 
394 aa  285  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  45.43 
 
 
400 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  45.95 
 
 
404 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
399 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  47.35 
 
 
399 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
398 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
398 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
398 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
398 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
398 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 
389 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  49.16 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.98 
 
 
390 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 
402 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  48.19 
 
 
399 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  48.19 
 
 
399 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 
406 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  47.37 
 
 
399 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  47.35 
 
 
399 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  47.35 
 
 
399 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  47.37 
 
 
399 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 
402 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.6 
 
 
399 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.08 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.08 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.82 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.08 
 
 
399 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.63 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
387 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
394 aa  250  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
394 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.09 
 
 
394 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.09 
 
 
394 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
394 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  45.05 
 
 
415 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.98 
 
 
394 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.98 
 
 
394 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.98 
 
 
394 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 
397 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.98 
 
 
394 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 
399 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.98 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  39.51 
 
 
399 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
413 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
399 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  39.51 
 
 
399 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.71 
 
 
394 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  39.51 
 
 
399 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  39.68 
 
 
391 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
394 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  45.38 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.76 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.65 
 
 
395 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.38 
 
 
411 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  42.67 
 
 
403 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 
394 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  44 
 
 
389 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
415 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  40.87 
 
 
394 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
389 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.67 
 
 
389 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.67 
 
 
389 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  41.69 
 
 
400 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  36.41 
 
 
407 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
391 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  41.69 
 
 
403 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.14 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.14 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.62 
 
 
399 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.43 
 
 
393 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  40.43 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.32 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  38.96 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  38.96 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  38.06 
 
 
425 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  38.96 
 
 
405 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
402 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
447 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
419 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.12 
 
 
399 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.12 
 
 
405 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.06 
 
 
401 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.12 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.12 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.12 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.12 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.12 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
402 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  37.84 
 
 
421 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>