290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4407 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  50.74 
 
 
271 aa  261  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  50.58 
 
 
251 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  45.35 
 
 
287 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  48.08 
 
 
297 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  46.3 
 
 
299 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  46.92 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  46.22 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  46.3 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  46.3 
 
 
287 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  44.98 
 
 
302 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  40.77 
 
 
304 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  43.45 
 
 
284 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.57 
 
 
289 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  45.7 
 
 
268 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  44.09 
 
 
285 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  42.97 
 
 
268 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  45.7 
 
 
305 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  44.92 
 
 
274 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  40.07 
 
 
292 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.08 
 
 
282 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  44.8 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  41.63 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  41.58 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  41.63 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  41.11 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  41.11 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  43.98 
 
 
301 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  43.41 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  39.69 
 
 
282 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  41.09 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  39.22 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  42.02 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  39 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  42.86 
 
 
297 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  44 
 
 
319 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  44 
 
 
319 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  44 
 
 
319 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  41.92 
 
 
342 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  42.25 
 
 
279 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  42.02 
 
 
284 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  41.86 
 
 
279 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  41.86 
 
 
276 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  41.73 
 
 
275 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  40.86 
 
 
342 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  39.06 
 
 
292 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  40.31 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  42.08 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  40.84 
 
 
261 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  40.98 
 
 
276 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  41.79 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  41.7 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  40.62 
 
 
299 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  39.92 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  47.31 
 
 
175 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.02 
 
 
229 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.74 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  53.44 
 
 
147 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.86 
 
 
273 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  44.25 
 
 
261 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  38.04 
 
 
263 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.2 
 
 
266 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  43.02 
 
 
242 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  45.86 
 
 
239 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  46.67 
 
 
263 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  45.09 
 
 
262 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  45.56 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  40.8 
 
 
266 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  46.47 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  34.69 
 
 
216 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  43.67 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  36.05 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  38.72 
 
 
247 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  48.1 
 
 
259 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  49.31 
 
 
275 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  38.59 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  44.32 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.83 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  41.76 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  46.9 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  43.83 
 
 
247 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  46.9 
 
 
263 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  39.44 
 
 
239 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  47.62 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  48.61 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  48.28 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  45.35 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.62 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.98 
 
 
252 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.3 
 
 
266 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.98 
 
 
252 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.62 
 
 
267 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>