More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4404 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  51.82 
 
 		 607 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 607 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  53.87 
 
 		 609 aa  647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  59.93 
 
 		 598 aa  732    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 		 615 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  52.51 
 
 		 610 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 615 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 		 606 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 		 609 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  51.32 
 
 		 607 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 614 aa  673    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 		 602 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.86 
 
 		 602 aa  652    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  53.27 
 
 		 613 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 609 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  53.92 
 
 		 603 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 		 606 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 614 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  54.27 
 
 		 614 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  54.27 
 
 		 614 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 		 614 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 602 aa  655    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 		 606 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 		 606 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  53.54 
 
 		 622 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  57.52 
 
 		 650 aa  694    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  54.1 
 
 		 598 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 		 606 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 		 610 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  59.27 
 
 		 599 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  56.19 
 
 		 630 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 609 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 606 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.69 
 
 		 602 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 		 608 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 610 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 		 600 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 		 608 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.34 
 
 		 602 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  59.77 
 
 		 598 aa  735    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 		 614 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  60.8 
 
 		 614 aa  750    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 		 614 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 600 aa  644    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  52.73 
 
 		 598 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 597 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 603 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  56.97 
 
 		 592 aa  692    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 608 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  56.06 
 
 		 615 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  57.29 
 
 		 620 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  53.18 
 
 		 600 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 		 608 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 		 608 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  53.51 
 
 		 602 aa  655    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  52.73 
 
 		 598 aa  641    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  54.85 
 
 		 602 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 		 596 aa  636    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 603 aa  643    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  57.77 
 
 		 613 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 		 609 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 607 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 603 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 605 aa  1228    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.16 
 
 		 593 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  52.73 
 
 		 598 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 623 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 		 610 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 		 610 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 		 615 aa  656    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.06 
 
 		 596 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 603 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 603 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 602 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.26 
 
 		 603 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 		 608 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 608 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.42 
 
 		 605 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  56.06 
 
 		 616 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 		 614 aa  678    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.5 
 
 		 618 aa  637    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.92 
 
 		 598 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.48 
 
 		 615 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 642 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 608 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  59.39 
 
 		 594 aa  720    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.97 
 
 		 607 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 		 603 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  54.17 
 
 		 602 aa  655    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  60.03 
 
 		 601 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  56.4 
 
 		 613 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 631 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  53.92 
 
 		 604 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  53.93 
 
 		 641 aa  675    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>