More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4395 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
879 aa  1781    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 
882 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
823 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  33.94 
 
 
869 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.99 
 
 
807 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.57 
 
 
813 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.76 
 
 
871 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  34.8 
 
 
821 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.66 
 
 
862 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34 
 
 
883 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 
805 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.97 
 
 
822 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.9 
 
 
796 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.19 
 
 
817 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.68 
 
 
809 aa  386  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.99 
 
 
805 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32 
 
 
814 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.17 
 
 
816 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.24 
 
 
805 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.89 
 
 
803 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.03 
 
 
802 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  29.96 
 
 
797 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.32 
 
 
807 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.13 
 
 
878 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.62 
 
 
865 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.13 
 
 
804 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.36 
 
 
805 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.91 
 
 
805 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  34.1 
 
 
808 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.79 
 
 
805 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.33 
 
 
809 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.2 
 
 
915 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.52 
 
 
893 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.75 
 
 
843 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.76 
 
 
887 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.07 
 
 
804 aa  324  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 
913 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 
888 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.46 
 
 
919 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.35 
 
 
798 aa  321  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.23 
 
 
887 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.23 
 
 
808 aa  317  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.87 
 
 
849 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  32.21 
 
 
800 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.2 
 
 
831 aa  310  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.27 
 
 
808 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.04 
 
 
812 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.55 
 
 
808 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.65 
 
 
844 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.75 
 
 
811 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.29 
 
 
810 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.46 
 
 
816 aa  293  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 
817 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.99 
 
 
803 aa  290  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.16 
 
 
845 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.89 
 
 
808 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 
810 aa  287  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  29.52 
 
 
817 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.83 
 
 
819 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.7 
 
 
803 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  28.98 
 
 
809 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.94 
 
 
821 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.25 
 
 
855 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
813 aa  273  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  30.35 
 
 
810 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.75 
 
 
846 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.89 
 
 
874 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 
820 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 
809 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.78 
 
 
880 aa  260  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.04 
 
 
806 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.2 
 
 
884 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  29.33 
 
 
835 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.63 
 
 
810 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  29.83 
 
 
848 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.21 
 
 
844 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.21 
 
 
819 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
810 aa  214  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  29.81 
 
 
861 aa  211  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  28.01 
 
 
931 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.18 
 
 
807 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.39 
 
 
828 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 
798 aa  145  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 
793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 
789 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 
807 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 
813 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
788 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
802 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 
830 aa  123  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
788 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
811 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
795 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 
816 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 
795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
804 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 
802 aa  115  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>