105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4301 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  286  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.58 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.05 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.09 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.13 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  35.05 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
150 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.24 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  29.7 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.29 
 
 
171 aa  47.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
152 aa  42  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  25.56 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
175 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  30.77 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>