More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4215 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 123 aa  237  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  43.81 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  43.69 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  40.95 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  36.27 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  36.27 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  34.62 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  35.92 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  38.24 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  33.98 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  31.36 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  31.07 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3388  ribosome-binding factor A  42.7 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.990819  hitchhiker  0.00369045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3560  ribosome-binding factor A  40.45 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  32.69 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  30.09 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  29.73 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  31.68 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>