More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4167 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
432 aa  874    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  48.43 
 
 
423 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  41.77 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  37.2 
 
 
484 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  41.61 
 
 
475 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  37.85 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  39.24 
 
 
463 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
687 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  37.75 
 
 
653 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  40.18 
 
 
431 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
652 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
774 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
963 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
795 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  38.54 
 
 
450 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 
374 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.23 
 
 
1682 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  34.64 
 
 
352 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  36.21 
 
 
324 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 
322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.27 
 
 
2122 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.77 
 
 
1383 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  35.44 
 
 
440 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.56 
 
 
322 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  36.13 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  27.42 
 
 
396 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.22 
 
 
371 aa  123  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.38 
 
 
1812 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  31.72 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  30.29 
 
 
1454 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.74 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  29.71 
 
 
371 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.88 
 
 
616 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.18 
 
 
901 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  29.14 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
619 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.62 
 
 
382 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  32.3 
 
 
422 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.78 
 
 
457 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
397 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
365 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 
422 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.28 
 
 
2036 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.28 
 
 
1969 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.38 
 
 
407 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.06 
 
 
475 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.32 
 
 
439 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.98 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.98 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 
546 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  30.58 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.38 
 
 
363 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 
363 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
611 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.7 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  26.07 
 
 
363 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.78 
 
 
448 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 
534 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.41 
 
 
1300 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 
797 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 
809 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  26.65 
 
 
556 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
861 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.46 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.15 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  27.3 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.45 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.38 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  26.79 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.48 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
643 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  25.65 
 
 
1067 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  21.85 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.34 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.14 
 
 
2272 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.27 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  27.7 
 
 
1328 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.03 
 
 
1241 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  25.37 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 
645 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  22.34 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  30.47 
 
 
497 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  27.42 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  27.42 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.94 
 
 
603 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.14 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>