More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4155 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  100 
 
 
717 aa  1463    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  31.59 
 
 
774 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  24.05 
 
 
729 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02602  transcriptional regulatory protein, C terminal  27.77 
 
 
772 aa  167  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  23.58 
 
 
725 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  24.55 
 
 
716 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  33.81 
 
 
469 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  24.17 
 
 
716 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  22.51 
 
 
712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.39 
 
 
700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3061  transcriptional regulator domain-containing protein  23.58 
 
 
716 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0196528  hitchhiker  0.000417149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1101  transcriptional regulator domain-containing protein  23.09 
 
 
713 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000631181  hitchhiker  0.00725129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0992  winged helix family two component response transcriptional regulator  23.63 
 
 
715 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  23.59 
 
 
714 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
969 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  21.15 
 
 
711 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  22.82 
 
 
693 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.7 
 
 
1097 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
919 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.67 
 
 
1005 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.37 
 
 
407 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  31.33 
 
 
449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.93 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  22.61 
 
 
711 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.76 
 
 
407 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  25.31 
 
 
1167 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.05 
 
 
439 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  31.33 
 
 
442 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  32.48 
 
 
442 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.51 
 
 
425 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 
298 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  30.34 
 
 
442 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  29.18 
 
 
441 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  30.9 
 
 
442 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  30.9 
 
 
442 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.16 
 
 
439 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  30.9 
 
 
442 aa  107  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0554  putative transcriptional regulator, CadC  22.86 
 
 
702 aa  107  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.04 
 
 
442 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.89 
 
 
427 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  30.21 
 
 
451 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  30.77 
 
 
442 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.79 
 
 
421 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  33.92 
 
 
425 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.04 
 
 
426 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  24.06 
 
 
756 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  29.18 
 
 
441 aa  103  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.52 
 
 
432 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  31.62 
 
 
440 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  30.34 
 
 
451 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.73 
 
 
457 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.41 
 
 
1062 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0937  transcriptional regulator, CadC  20.37 
 
 
696 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  28.74 
 
 
439 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.23 
 
 
1062 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.19 
 
 
424 aa  102  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.15 
 
 
414 aa  102  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  19.61 
 
 
678 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  34.15 
 
 
433 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  34.15 
 
 
433 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  34.76 
 
 
433 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  34.76 
 
 
423 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  34.15 
 
 
423 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  30.04 
 
 
434 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.78 
 
 
443 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  34.15 
 
 
423 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.61 
 
 
443 aa  100  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.93 
 
 
461 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.66 
 
 
428 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.31 
 
 
440 aa  99.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.04 
 
 
441 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1312  TolB domain-containing protein  24.69 
 
 
413 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.31 
 
 
1082 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.74 
 
 
434 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  30.9 
 
 
434 aa  99.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.33 
 
 
1062 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  31.42 
 
 
415 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.6 
 
 
1078 aa  99  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.3 
 
 
1062 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.4 
 
 
1090 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  27.97 
 
 
474 aa  98.2  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.37 
 
 
445 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  30.35 
 
 
434 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.64 
 
 
354 aa  98.2  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.39 
 
 
514 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  30.35 
 
 
434 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  20.69 
 
 
691 aa  97.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.39 
 
 
514 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.73 
 
 
435 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  29.36 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  29.36 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  26.09 
 
 
422 aa  96.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  29.36 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.27 
 
 
446 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  29.36 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>