31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4132 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.08 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.68 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.68 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.68 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  20.25 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.75 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.46 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.62 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  20.74 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.83 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2407  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.13 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.797019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.41 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.7 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.53 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.22 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2340  hypothetical protein  23.66 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0184096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  24.62 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.08 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.01 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.72 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  21.98 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.19 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  27.42 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.63 
 
 		 368 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  22.13 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.54 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>