More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4086 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  100 
 
 
368 aa  741    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  62.81 
 
 
372 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  61.98 
 
 
372 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  60.22 
 
 
369 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  55.01 
 
 
364 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  53.57 
 
 
365 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  51.21 
 
 
365 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  51.75 
 
 
373 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  50.41 
 
 
363 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  52.99 
 
 
370 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  50.82 
 
 
361 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  50.41 
 
 
359 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  50.94 
 
 
368 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  48.49 
 
 
360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  50.95 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  48.22 
 
 
362 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  49.04 
 
 
364 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  43.09 
 
 
368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  50.54 
 
 
358 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  48.08 
 
 
359 aa  310  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  49.86 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  47.67 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  45.01 
 
 
366 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  45.28 
 
 
365 aa  295  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  46.7 
 
 
375 aa  295  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  44.96 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  45.75 
 
 
360 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  43.29 
 
 
370 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  47.14 
 
 
348 aa  281  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  46.07 
 
 
360 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  46.07 
 
 
360 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  43.45 
 
 
340 aa  276  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  47.16 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  48.7 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  48.01 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  47.26 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  47.56 
 
 
341 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.33 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  43.17 
 
 
362 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  47.26 
 
 
341 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  43.16 
 
 
366 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  47.13 
 
 
346 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.07 
 
 
349 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  46.38 
 
 
340 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  46.97 
 
 
342 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  41.64 
 
 
350 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  46.4 
 
 
342 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  41.64 
 
 
350 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  46.29 
 
 
341 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  44.83 
 
 
345 aa  258  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  41.96 
 
 
365 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  42.06 
 
 
341 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  45.27 
 
 
343 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  45.03 
 
 
339 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  44.99 
 
 
343 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 
345 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  46.4 
 
 
341 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
341 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  44.99 
 
 
343 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  42.06 
 
 
341 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  44.32 
 
 
344 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  46.26 
 
 
342 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  44.96 
 
 
341 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  43.68 
 
 
341 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  44.09 
 
 
341 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  43.52 
 
 
341 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  39.95 
 
 
378 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.07 
 
 
344 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  43.55 
 
 
343 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  43.55 
 
 
343 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  43.55 
 
 
343 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  44.57 
 
 
341 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  40.74 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  45.11 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  42.33 
 
 
342 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  44.54 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  38.33 
 
 
319 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  39.74 
 
 
390 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  40.85 
 
 
357 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 
351 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  43.68 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  39.63 
 
 
360 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  38.68 
 
 
332 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  39.2 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 
323 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  40.87 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  38.05 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  38.05 
 
 
319 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  39.72 
 
 
319 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  35.64 
 
 
403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 
322 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
324 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  38.12 
 
 
319 aa  206  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  37.43 
 
 
319 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  35.99 
 
 
327 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  37.05 
 
 
323 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  36.65 
 
 
319 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>