More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4021 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  100 
 
 		 345 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 		 353 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  39.67 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  40.13 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.57 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  30.89 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.54 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  28.62 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  29.1 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  28.22 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.01 
 
 		 505 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.88 
 
 		 517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.04 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.79 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.68 
 
 		 509 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  30.21 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  31.45 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  26.67 
 
 		 434 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  25.06 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  32.44 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.96 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.32 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.32 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.92 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.02 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  32.53 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 		 432 aa  95.9  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.71 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  26.43 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.96 
 
 		 432 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 478 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.92 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.83 
 
 		 404 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.73 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 400 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 420 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  28.66 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 		 471 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  27.92 
 
 		 421 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  25.85 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.39 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.47 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  29.64 
 
 		 420 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  26.91 
 
 		 489 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 418 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  30.04 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  24.49 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  30.2 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  28.33 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  24.49 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.47 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 424 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.91 
 
 		 479 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.67 
 
 		 428 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  28.13 
 
 		 475 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 		 418 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  28.13 
 
 		 475 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  29.74 
 
 		 411 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.45 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.13 
 
 		 470 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.45 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3980  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 		 607 aa  86.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>