More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3994 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  100 
 
 
318 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.23 
 
 
315 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
321 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.97 
 
 
305 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  38.06 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 
295 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.46 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 
321 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  38.28 
 
 
304 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
309 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
306 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  37.62 
 
 
306 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  32.72 
 
 
325 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  37.3 
 
 
306 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  37.62 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  33.58 
 
 
326 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  36.08 
 
 
296 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  35.2 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  35.53 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  35.53 
 
 
296 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  35.53 
 
 
296 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  33.22 
 
 
296 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  35.58 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  35.35 
 
 
316 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  29.05 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.96 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  32.75 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
348 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
314 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  30.66 
 
 
299 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  32.51 
 
 
307 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  29.82 
 
 
292 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  33.67 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  33.67 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  33.67 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  31.61 
 
 
519 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  33.55 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  28.62 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  33.1 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  27.67 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  26.17 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  29.25 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  27.67 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
309 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  27.67 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  29.86 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  27.33 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  27.33 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  27.3 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.5 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  24.5 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.49 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  32.49 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  32.49 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  32.49 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  32.49 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  29.55 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  31.63 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  27.59 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  31.52 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.01 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.68 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.48 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  30.79 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  28.9 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  28.21 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  26.14 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  28.28 
 
 
494 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  26.14 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.45 
 
 
414 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  24.71 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.1 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  24.71 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>