More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3943 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  43.53 
 
 
247 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  45.87 
 
 
247 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  41.96 
 
 
247 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.79 
 
 
259 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.04 
 
 
251 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.67 
 
 
256 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.91 
 
 
233 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  37.92 
 
 
262 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 
262 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 
262 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.87 
 
 
258 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.09 
 
 
258 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.5 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  33.98 
 
 
318 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.79 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 
249 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  36.22 
 
 
249 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  36.79 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  36.27 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  38.71 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  34.01 
 
 
255 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  32.84 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
239 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  32.84 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  36.75 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  35.42 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 
258 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.51 
 
 
259 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 
262 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.95 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.95 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.49 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.01 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  36.54 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.43 
 
 
495 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.01 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.04 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.04 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.04 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.04 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.04 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.83 
 
 
240 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 
263 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.44 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.13 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 
263 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
262 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.13 
 
 
234 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  33.51 
 
 
263 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.73 
 
 
261 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  36.13 
 
 
262 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
259 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
263 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.97 
 
 
517 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.71 
 
 
257 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  29.18 
 
 
260 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  34.39 
 
 
256 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 
259 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  33.72 
 
 
259 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  30.54 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  29.84 
 
 
234 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.9 
 
 
315 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  29.84 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.14 
 
 
315 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  29.46 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.36 
 
 
328 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.16 
 
 
315 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.33 
 
 
317 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.47 
 
 
331 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.82 
 
 
313 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.91 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.36 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.21 
 
 
332 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.98 
 
 
319 aa  89  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.98 
 
 
319 aa  89  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.37 
 
 
322 aa  89  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  49.38 
 
 
315 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  49.38 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.03 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.1 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.55 
 
 
331 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.56 
 
 
298 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.36 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  37.9 
 
 
319 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.97 
 
 
301 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.86 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.8 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>