129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3909 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1153 aa  2365  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  6.52763e-05  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  33.31 
 
 
1124 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  30.44 
 
 
1173 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  31.79 
 
 
1210 aa  439  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
1206 aa  417  1e-115  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 
1176 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
1232 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.95 
 
 
1196 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
1105 aa  342  3e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
1123 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.2 
 
 
1195 aa  335  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
1123 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.37 
 
 
1125 aa  327  8e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
1149 aa  325  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
1167 aa  320  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.09 
 
 
1069 aa  310  7e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  4.6909e-05  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.43 
 
 
1075 aa  306  1e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.63 
 
 
1194 aa  298  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
1065 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.26 
 
 
1203 aa  274  8e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.03 
 
 
1141 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.54 
 
 
1162 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
1105 aa  254  8e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
1114 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.28 
 
 
1194 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25.66 
 
 
1132 aa  235  4e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.43 
 
 
1122 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.07 
 
 
1162 aa  228  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.3 
 
 
1298 aa  214  5e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.81 
 
 
1075 aa  204  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.76 
 
 
511 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  26.91 
 
 
710 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  29.58 
 
 
1257 aa  140  9e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  31.37 
 
 
986 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  29.67 
 
 
1161 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 
1041 aa  122  4e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.61 
 
 
1067 aa  114  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 
1097 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24.64 
 
 
1077 aa  111  9e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.77 
 
 
966 aa  109  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.02 
 
 
1052 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.56 
 
 
1068 aa  105  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.29 
 
 
1071 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  29.97 
 
 
979 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.39 
 
 
1125 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.43 
 
 
1053 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25 
 
 
1056 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
1188 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 
1066 aa  98.6  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.22 
 
 
1105 aa  94.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 
1010 aa  92.8  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  26.44 
 
 
1008 aa  91.7  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
1008 aa  91.7  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.6 
 
 
1126 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.28 
 
 
1068 aa  89.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.84 
 
 
1122 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.84 
 
 
1120 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.2 
 
 
1010 aa  88.2  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.8 
 
 
1074 aa  87.8  1e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.86 
 
 
992 aa  85.9  4e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  26.62 
 
 
1129 aa  82.8  3e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25 
 
 
993 aa  82.8  4e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 
1074 aa  80.9  1e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
991 aa  81.3  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.14 
 
 
1061 aa  76.6  2e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  27.19 
 
 
1081 aa  76.3  3e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
888 aa  75.5  5e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
1026 aa  75.1  8e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.06 
 
 
1109 aa  73.2  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  27.71 
 
 
997 aa  71.6  8e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  21.96 
 
 
1071 aa  71.2  9e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.81 
 
 
994 aa  71.2  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.22 
 
 
1037 aa  70.9  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 
1054 aa  71.2  1e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
1016 aa  70.9  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 
1100 aa  68.9  5e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.31 
 
 
1050 aa  67.8  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.02 
 
 
1001 aa  67.8  1e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.03 
 
 
1012 aa  67  2e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27 
 
 
952 aa  66.6  3e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
871 aa  66.2  3e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 
1066 aa  66.6  3e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
1007 aa  65.5  6e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
1007 aa  62.4  5e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.48 
 
 
1007 aa  62  6e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.66 
 
 
972 aa  60.8  1e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.32 
 
 
1041 aa  60.8  1e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 
1116 aa  60.5  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
897 aa  59.3  4e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 
753 aa  57.4  2e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
749 aa  57  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 
866 aa  56.6  3e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
935 aa  55.8  5e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 
1066 aa  55.8  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
966 aa  55.1  8e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 
804 aa  54.3  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.6 
 
 
1066 aa  54.7  1e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 
791 aa  53.9  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.2223e-05  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
798 aa  53.1  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.58 
 
 
780 aa  51.6  8e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>