More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3902 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
357 aa  744    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  40.67 
 
 
300 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  41.27 
 
 
323 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  39.7 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  40.19 
 
 
297 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 
301 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  40.49 
 
 
299 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  39.01 
 
 
299 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  38.44 
 
 
324 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  37 
 
 
300 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  39.7 
 
 
305 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  38.63 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  40.31 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  36 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  36.83 
 
 
311 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  38.3 
 
 
318 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  37.35 
 
 
299 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  37.35 
 
 
299 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 
302 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  39.45 
 
 
335 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  38.53 
 
 
334 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 
298 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  35.19 
 
 
300 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.93 
 
 
305 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  36.31 
 
 
305 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  36.31 
 
 
305 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 
305 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  36.17 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 
333 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  34.85 
 
 
304 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  37.16 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 
308 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  36.94 
 
 
306 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  34.91 
 
 
317 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  34.91 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 
316 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  33.93 
 
 
306 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.34 
 
 
304 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  34.23 
 
 
306 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 
300 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  32.93 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.17 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 
300 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  32.13 
 
 
305 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  35.87 
 
 
304 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  32.94 
 
 
307 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 
298 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  33.33 
 
 
300 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 
300 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.37 
 
 
305 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  33.74 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  33.13 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 
315 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  34.46 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  32.13 
 
 
302 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  32.34 
 
 
307 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  32.13 
 
 
302 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  31.83 
 
 
302 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  31.83 
 
 
302 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  32.73 
 
 
307 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  32.83 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  33.94 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 
308 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  37.38 
 
 
296 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  35.12 
 
 
294 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  31.23 
 
 
306 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  32.53 
 
 
300 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  34.73 
 
 
297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  31.07 
 
 
350 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  36.18 
 
 
224 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  33.75 
 
 
323 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  31.89 
 
 
294 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  29.38 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  30.4 
 
 
393 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5329  histone deacetylase superfamily  30.62 
 
 
577 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  32.1 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  29.94 
 
 
594 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  28.75 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  27.06 
 
 
365 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  29.97 
 
 
387 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  28.36 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  27.76 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  27.48 
 
 
487 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  34.05 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  26.49 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  27.93 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  30.49 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  29.51 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  25.47 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  25.47 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.07 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>