More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3892 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 492 aa  999    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 501 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 499 aa  326  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.21 
 
 		 481 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 506 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 506 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 476 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 513 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 501 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.93 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.71 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.85 
 
 		 501 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 501 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 516 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.26 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 502 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 502 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 502 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.99 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.05 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.51 
 
 		 501 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 476 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.12 
 
 		 515 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 504 aa  309  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.9 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 478 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 502 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  37.42 
 
 		 521 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  42.08 
 
 		 501 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.92 
 
 		 497 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  39.67 
 
 		 509 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 561 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 564 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 546 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.08 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 564 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 502 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 562 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.16 
 
 		 504 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 509 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 564 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 564 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 502 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 502 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 492 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 492 aa  289  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 503 aa  289  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>