115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3889 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  55.17 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  28.8 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  32.17 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  28.57 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  30 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30.63 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  33.04 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3732  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.7 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  26.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  40.54 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  23.77 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  23.77 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  23.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  28.44 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  28.8 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  23.28 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  23.28 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  23.28 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  25 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  28.69 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  24.07 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  32.04 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  31.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  22.95 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  21.55 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  22.95 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  25.2 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  22.95 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  30.08 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  28.24 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  26.5 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  24.17 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  25.64 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  22.86 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  33.73 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  24.59 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  25.83 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  23.36 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  19.17 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  22.31 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  22.03 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25.56 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.78 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  24.59 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  26.53 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  34.15 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  21.7 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  23.58 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  21.5 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  23.21 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  30.26 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  24.42 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  18.1 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  26.44 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  31.63 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>