More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3863 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  100 
 
 		 680 aa  1289    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  47.26 
 
 		 271 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  50.78 
 
 		 239 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  46.04 
 
 		 624 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  48.15 
 
 		 266 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  45.86 
 
 		 266 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  46.4 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  50.19 
 
 		 251 aa  224  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 237 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.83 
 
 		 247 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  46.88 
 
 		 274 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.47 
 
 		 258 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  49.22 
 
 		 236 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  48.65 
 
 		 240 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  44.24 
 
 		 264 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  46.88 
 
 		 309 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  44.62 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  46.79 
 
 		 255 aa  207  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  47.86 
 
 		 728 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  44.19 
 
 		 238 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  42.21 
 
 		 245 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  46.21 
 
 		 243 aa  201  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  44.66 
 
 		 273 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  42.59 
 
 		 245 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  45.74 
 
 		 238 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  44.06 
 
 		 243 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.63 
 
 		 245 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.63 
 
 		 245 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  43.63 
 
 		 241 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  43.19 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3919  pseudouridine synthase  39.22 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  41.31 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  42.8 
 
 		 242 aa  188  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4420  RNA-binding S4 domain protein  38.91 
 
 		 638 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4141  pseudouridine synthase  39.62 
 
 		 554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0498  RNA-binding S4 domain protein  41.18 
 
 		 472 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 249 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1493  pseudouridine synthase  40.93 
 
 		 426 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.797477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0976  pseudouridine synthase  38.55 
 
 		 694 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0989035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 403 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  41.38 
 
 		 329 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  41.38 
 
 		 324 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  42.97 
 
 		 236 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.53 
 
 		 238 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  42.53 
 
 		 242 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  41.7 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  44.36 
 
 		 282 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  41.39 
 
 		 230 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 242 aa  180  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  41.67 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  41.67 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.15 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 242 aa  180  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  41.31 
 
 		 235 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  42.08 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  41.44 
 
 		 242 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  35.8 
 
 		 736 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.44 
 
 		 242 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  40.23 
 
 		 274 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1396  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 239 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.131517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 243 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 240 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.23 
 
 		 239 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  43.41 
 
 		 306 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4142  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  42.26 
 
 		 250 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 328 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0723  pseudouridine synthase  45.21 
 
 		 279 aa  174  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0159498  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1203  pseudouridine synthase  37.35 
 
 		 516 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0112543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 261 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.15 
 
 		 249 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.47 
 
 		 251 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  39.86 
 
 		 354 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14070  pseudouridine synthase family protein  41.38 
 
 		 318 aa  172  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3094  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.02 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1709  RNA-binding S4 domain protein  40.93 
 
 		 387 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.397798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 256 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  42.11 
 
 		 251 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0143  pseudouridylate synthase (ribosomal large subunit pseudouridine synthase B)  39.61 
 
 		 562 aa  170  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  39.93 
 
 		 252 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  39.93 
 
 		 252 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1171  pseudouridine synthase Rsu  38.91 
 
 		 784 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.36 
 
 		 269 aa  169  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1273  pseudouridine synthase Rsu  34.15 
 
 		 795 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  39.45 
 
 		 687 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1997  pseudouridine synthase  37.55 
 
 		 252 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2550  pseudouridine synthase, Rsu  39.52 
 
 		 680 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0219746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1211  pseudouridine synthase  42.31 
 
 		 243 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  39.62 
 
 		 375 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.27 
 
 		 236 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  43.08 
 
 		 262 aa  167  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  41.27 
 
 		 236 aa  167  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1689  pseudouridine synthase  41.3 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0924391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0907  pseudouridine synthase Rsu  39.76 
 
 		 743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.72 
 
 		 255 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1038  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.25 
 
 		 332 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2266  pseudouridine synthase  40.64 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  41.57 
 
 		 253 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>