More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3659 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  100 
 
 
362 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.2 
 
 
356 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  35.83 
 
 
681 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  37.05 
 
 
353 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.51 
 
 
713 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.22 
 
 
704 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  34.34 
 
 
356 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.98 
 
 
353 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  34.94 
 
 
342 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  34.34 
 
 
356 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.12 
 
 
686 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  33.54 
 
 
688 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  34.65 
 
 
332 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  35 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  32.84 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.53 
 
 
710 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0744  diguanylate cyclase  44 
 
 
753 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165088  normal  0.416995 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.59 
 
 
494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  31.69 
 
 
836 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  31 
 
 
792 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.55 
 
 
473 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.29 
 
 
841 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  39.37 
 
 
458 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  35.69 
 
 
388 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0691  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.01 
 
 
742 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  38.91 
 
 
609 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.65 
 
 
1125 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.87 
 
 
458 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.5 
 
 
459 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
1073 aa  156  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1165  diguanylate cyclase  38.84 
 
 
459 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000192138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  29.85 
 
 
554 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  38.46 
 
 
709 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.4 
 
 
732 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.5 
 
 
947 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  29.17 
 
 
733 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.44 
 
 
454 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  30.5 
 
 
462 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  30.88 
 
 
494 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  29.55 
 
 
785 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  30.88 
 
 
494 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1474  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.01 
 
 
465 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.36 
 
 
756 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.82 
 
 
550 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.49 
 
 
586 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6322  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.14 
 
 
682 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314546  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  37.85 
 
 
465 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  35.18 
 
 
563 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  37.08 
 
 
439 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2393  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.44 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  30.37 
 
 
758 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.62 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1214  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.09 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.302028  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.06 
 
 
499 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1471  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.62 
 
 
455 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1566  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.62 
 
 
455 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.94 
 
 
469 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
764 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.22 
 
 
558 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
764 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
574 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  35.14 
 
 
764 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
574 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.48 
 
 
563 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2866  diguanylate cyclase with GAF sensor  28 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.11 
 
 
772 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  33.18 
 
 
498 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  26.24 
 
 
510 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  41.57 
 
 
638 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.94 
 
 
675 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  40.94 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.03 
 
 
826 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.825062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.46 
 
 
415 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.21 
 
 
314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  35.19 
 
 
866 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  42.44 
 
 
457 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  33.02 
 
 
494 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  33.02 
 
 
494 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  40.59 
 
 
548 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3445  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.35 
 
 
1094 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.25 
 
 
748 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.21 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  28.65 
 
 
717 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.84 
 
 
668 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.31 
 
 
797 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  31.7 
 
 
718 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.84 
 
 
668 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.42 
 
 
777 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  33.18 
 
 
369 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
373 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.81 
 
 
597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.7 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  34.84 
 
 
680 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0125  GGDEF domain-containing protein  33.92 
 
 
371 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.41 
 
 
781 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 
322 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1177  two component signal transduction response regulator  28.65 
 
 
470 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
548 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  32.46 
 
 
608 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.18 
 
 
741 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>