140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3649 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3649  hemerythrin-like, metal-binding  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16393  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  26.83 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  29.58 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  30.88 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  28.67 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  28.32 
 
 
199 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  28.32 
 
 
199 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  27.61 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.88 
 
 
135 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  29.06 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  24.19 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  30.95 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.17 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.93 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  25 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.23 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.97 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  25 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  29.03 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  26.02 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  32 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  27.36 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  26.77 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  27.07 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
941 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 
722 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  28.95 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 
526 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  22.88 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  23.58 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  26.81 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 
529 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 
529 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  26.45 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 
529 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  24.79 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  24.43 
 
 
138 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25.64 
 
 
667 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.88 
 
 
1032 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  21.6 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 
779 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  25.58 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  27.82 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 
579 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  27.56 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  27.27 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  32.79 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.69 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  26.5 
 
 
253 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  24.41 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0083  hypothetical protein  24.24 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.69 
 
 
515 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  22.5 
 
 
529 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  30.33 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  21.31 
 
 
360 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  26.85 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.34 
 
 
133 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  23.74 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.67 
 
 
529 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.67 
 
 
529 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.67 
 
 
529 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.67 
 
 
529 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.87 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  23.94 
 
 
155 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  27.34 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.42 
 
 
689 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0266  hypothetical protein  27.64 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  26.89 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  32.14 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0044  hypothetical protein  26.45 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  22.69 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.05 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  28.46 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  23.2 
 
 
519 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  27.05 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  22.66 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.03 
 
 
926 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  25.83 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.83 
 
 
518 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>