More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3647 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 821 aa  1654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.42 
 
 		 817 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.55 
 
 		 813 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.85 
 
 		 805 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.78 
 
 		 796 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.34 
 
 		 871 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.3 
 
 		 869 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 823 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.45 
 
 		 816 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.22 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.61 
 
 		 807 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.08 
 
 		 822 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 		 882 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.57 
 
 		 821 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.53 
 
 		 805 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  34.06 
 
 		 819 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.62 
 
 		 807 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.1 
 
 		 831 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 809 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.91 
 
 		 915 aa  344  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.62 
 
 		 798 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 805 aa  341  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  31.9 
 
 		 805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 		 805 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.83 
 
 		 797 aa  337  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 		 862 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 893 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.73 
 
 		 803 aa  334  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  29.77 
 
 		 804 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.82 
 
 		 874 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.6 
 
 		 855 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 		 844 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.62 
 
 		 816 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.67 
 
 		 913 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.73 
 
 		 808 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.73 
 
 		 809 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  32.65 
 
 		 811 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.63 
 
 		 849 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.21 
 
 		 919 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.79 
 
 		 809 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.88 
 
 		 887 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 808 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 		 810 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.3 
 
 		 808 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.24 
 
 		 800 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.67 
 
 		 817 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  30.94 
 
 		 802 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.03 
 
 		 865 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.7 
 
 		 845 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.76 
 
 		 883 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  29.86 
 
 		 805 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  30.09 
 
 		 804 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.84 
 
 		 878 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.43 
 
 		 887 aa  280  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.53 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 812 aa  277  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 817 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.37 
 
 		 803 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.53 
 
 		 848 aa  265  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.62 
 
 		 884 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.22 
 
 		 843 aa  260  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31 
 
 		 808 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.6 
 
 		 803 aa  258  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  27.43 
 
 		 810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  30.17 
 
 		 810 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 879 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  30.21 
 
 		 819 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.55 
 
 		 846 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.85 
 
 		 880 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.39 
 
 		 820 aa  234  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.59 
 
 		 888 aa  234  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.21 
 
 		 844 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  30.46 
 
 		 806 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.07 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  24.85 
 
 		 809 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  27.98 
 
 		 835 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  29.65 
 
 		 861 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 813 aa  211  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.35 
 
 		 807 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.61 
 
 		 828 aa  187  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.96 
 
 		 931 aa  185  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 802 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  22.15 
 
 		 830 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 		 797 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 		 791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 805 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 811 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 798 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 800 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 816 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 800 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 804 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 809 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 		 800 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 		 793 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 807 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 795 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>