More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3623 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  100 
 
 
408 aa  802    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  43 
 
 
419 aa  289  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  43.69 
 
 
414 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  42.05 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  41.54 
 
 
405 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  39.95 
 
 
402 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  38.89 
 
 
400 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  36.48 
 
 
401 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  43.23 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  41.56 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  38.78 
 
 
426 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  40.73 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  39.84 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  40 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  38.34 
 
 
396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  39.53 
 
 
429 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  39.53 
 
 
429 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  28.67 
 
 
419 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  38.56 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  33.25 
 
 
423 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  33.73 
 
 
415 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  36.96 
 
 
414 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.31 
 
 
421 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  31.16 
 
 
426 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  30.39 
 
 
427 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  33.99 
 
 
413 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.28 
 
 
440 aa  156  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  30.02 
 
 
427 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  28.04 
 
 
441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  28.14 
 
 
441 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  28.21 
 
 
441 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  28.04 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  28.21 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  27.91 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  29.18 
 
 
451 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.47 
 
 
422 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  29.11 
 
 
424 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  29.76 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.71 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  29.14 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  28.57 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  28.28 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.21 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  28.22 
 
 
431 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  29.14 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.71 
 
 
425 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.6 
 
 
425 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  27.27 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  27.51 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  30.77 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.08 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  27.51 
 
 
441 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  31.76 
 
 
431 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  27.84 
 
 
441 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  30.56 
 
 
422 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  27.57 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  27.78 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  27.78 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  27.51 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  27.51 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  27.51 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  27.51 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  27.51 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  27.74 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  30.05 
 
 
397 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.93 
 
 
405 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  28.32 
 
 
465 aa  126  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  28.33 
 
 
424 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  28.31 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  28.69 
 
 
411 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  29.27 
 
 
413 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  30.26 
 
 
423 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.39 
 
 
437 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  28.24 
 
 
428 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  29.47 
 
 
417 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.22 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.57 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  27.68 
 
 
424 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.12 
 
 
436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  27.19 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  30.37 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  27.19 
 
 
408 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.87 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  28.19 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  29.02 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  27.27 
 
 
422 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  28.23 
 
 
422 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  28.25 
 
 
429 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  28.24 
 
 
421 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  26.4 
 
 
413 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  26.82 
 
 
413 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  27.89 
 
 
417 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  28.68 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  26.63 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  26.03 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>