55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3599 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1397    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  41.68 
 
 		 791 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1030 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  38.29 
 
 		 1351 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 		 850 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.27 
 
 		 1750 aa  85.1  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 892 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 2961 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  43.27 
 
 		 2831 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1763 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  35.16 
 
 		 1046 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  40.95 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 719 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  38.64 
 
 		 425 aa  62  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1051 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  22.97 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  34.82 
 
 		 1916 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  47.89 
 
 		 1321 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  35.71 
 
 		 2350 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.08 
 
 		 439 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  28.43 
 
 		 1736 aa  54.3  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  25.18 
 
 		 2296 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.76 
 
 		 930 aa  53.9  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.54 
 
 		 646 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 		 831 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.64 
 
 		 929 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.88 
 
 		 841 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 		 387 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  27.69 
 
 		 359 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  31.07 
 
 		 1428 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  24.09 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 		 807 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.9 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.61 
 
 		 498 aa  48.5  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.64 
 
 		 1212 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.07 
 
 		 676 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  31.03 
 
 		 362 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  32.99 
 
 		 448 aa  47.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  31.07 
 
 		 1424 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.12 
 
 		 693 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  32.24 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  28.86 
 
 		 607 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.4 
 
 		 395 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 		 863 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.64 
 
 		 1292 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.91 
 
 		 579 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  39.51 
 
 		 1082 aa  45.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  33.67 
 
 		 586 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27 
 
 		 752 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.89 
 
 		 346 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.28 
 
 		 930 aa  43.9  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>