273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3491 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  100 
 
 
426 aa  871    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.82 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.84 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.25 
 
 
433 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.64 
 
 
438 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  25.61 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.15 
 
 
568 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.06 
 
 
407 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  25.75 
 
 
441 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  27.41 
 
 
405 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.47 
 
 
413 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.73 
 
 
445 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.27 
 
 
400 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  27.34 
 
 
440 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.81 
 
 
426 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.48 
 
 
459 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.79 
 
 
423 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.74 
 
 
432 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.05 
 
 
430 aa  103  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.36 
 
 
432 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.11 
 
 
432 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  27.7 
 
 
407 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  24.88 
 
 
421 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.95 
 
 
470 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.21 
 
 
433 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  28.81 
 
 
423 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.64 
 
 
426 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  28.49 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  26.81 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.3 
 
 
433 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.76 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.92 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.21 
 
 
448 aa  97.1  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.81 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.98 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
445 aa  96.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.68 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.2 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.54 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.38 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.49 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.17 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.26 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  24.39 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.98 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.12 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.57 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.4 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  27.36 
 
 
407 aa  93.2  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.49 
 
 
426 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.68 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.01 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.78 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  25.12 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.84 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  25.19 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  24 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  29.43 
 
 
381 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.84 
 
 
413 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  29.26 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  25.5 
 
 
409 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  27.02 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  28.1 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  25.45 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  26.38 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  26.38 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  26.38 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.14 
 
 
416 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  22.48 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  24.94 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  28.84 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.87 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  26.07 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  26.07 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  26.07 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.94 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.08 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  29.44 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  25.13 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  25.38 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  25.53 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  21.57 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  28.05 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  23.2 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.25 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.14 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  26.88 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  24.09 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  25.94 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  25.49 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.89 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25.67 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  24.77 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.69 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  25 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  25.53 
 
 
486 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  24.06 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.76 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.98 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>