More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3487 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.03 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  43.67 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  43.63 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  42 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  39.92 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  38.26 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  36.4 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.33 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.55 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  39.36 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.43 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  34.89 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  35.29 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  32.8 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  33.2 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.96 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.96 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  34.9 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.55 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  33.2 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.96 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.23 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.43 
 
 		 232 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.29 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.74 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.27 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.8 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.11 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.11 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2883  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.52 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000903631  unclonable  0.0000000000401288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.11 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.11 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  35.27 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  35.34 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3483  LytTR family two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.87 
 
 		 239 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  34.27 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.04 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  31.89 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.81 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  31.58 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  31.5 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  31.89 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  31.89 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  31.89 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  31.89 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.95 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  31.5 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.3 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  31.58 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.62 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.6 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  32.75 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.73 
 
 		 241 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  31.35 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  31.35 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.63 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.73 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.17 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.27 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  33.85 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>