More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3471 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
893 aa  1775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.99 
 
 
817 aa  439  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.92 
 
 
823 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.38 
 
 
814 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.44 
 
 
869 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  35.26 
 
 
796 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.25 
 
 
862 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.77 
 
 
813 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.48 
 
 
871 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 
805 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.09 
 
 
882 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.84 
 
 
822 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.57 
 
 
805 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.9 
 
 
807 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33.61 
 
 
802 aa  364  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.8 
 
 
800 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.24 
 
 
797 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 
809 aa  361  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.68 
 
 
805 aa  360  8e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.29 
 
 
804 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 
807 aa  359  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 
878 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.86 
 
 
821 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.64 
 
 
915 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  32.81 
 
 
798 aa  348  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.75 
 
 
865 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.09 
 
 
816 aa  341  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.12 
 
 
821 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.04 
 
 
887 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.97 
 
 
805 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.54 
 
 
803 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.3 
 
 
831 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 
880 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.47 
 
 
883 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.74 
 
 
808 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.25 
 
 
809 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.53 
 
 
817 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.97 
 
 
874 aa  324  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.43 
 
 
919 aa  324  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.58 
 
 
845 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 
855 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.39 
 
 
887 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.29 
 
 
805 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 
913 aa  317  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.67 
 
 
816 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.33 
 
 
811 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.87 
 
 
805 aa  310  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.78 
 
 
804 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  32.32 
 
 
808 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.39 
 
 
849 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.59 
 
 
810 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.55 
 
 
844 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.9 
 
 
810 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.07 
 
 
819 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.16 
 
 
806 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.52 
 
 
879 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.69 
 
 
884 aa  297  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.35 
 
 
846 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32.27 
 
 
808 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.98 
 
 
803 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.42 
 
 
808 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 
888 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.9 
 
 
808 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.76 
 
 
812 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  28.69 
 
 
809 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.75 
 
 
843 aa  260  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.59 
 
 
803 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  31.64 
 
 
810 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.34 
 
 
817 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 
820 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.32 
 
 
835 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  30.27 
 
 
819 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  30.84 
 
 
861 aa  242  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
813 aa  241  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.26 
 
 
828 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 
810 aa  234  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.67 
 
 
844 aa  227  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  29.35 
 
 
848 aa  227  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.76 
 
 
931 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.43 
 
 
810 aa  204  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.33 
 
 
809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  23.78 
 
 
807 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
790 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 
809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
805 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 
802 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 
793 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
804 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
804 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  25.05 
 
 
807 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 
813 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 
804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 
790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 
806 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 
801 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 
800 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 
788 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 
808 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
798 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 
792 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>