More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3459 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
817 aa  1653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.83 
 
 
813 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.72 
 
 
823 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.5 
 
 
805 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  38.25 
 
 
814 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.53 
 
 
871 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  37.53 
 
 
821 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.48 
 
 
807 aa  490  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  38.72 
 
 
796 aa  492  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  37.31 
 
 
831 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.9 
 
 
822 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.86 
 
 
882 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.05 
 
 
807 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  37.41 
 
 
869 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.57 
 
 
816 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.53 
 
 
809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.41 
 
 
805 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  35.57 
 
 
798 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.69 
 
 
805 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.61 
 
 
878 aa  426  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  37.21 
 
 
800 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  35.79 
 
 
809 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.42 
 
 
821 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  37.5 
 
 
803 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.86 
 
 
893 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.3 
 
 
805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.57 
 
 
915 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  36.4 
 
 
808 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.1 
 
 
805 aa  399  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  35.89 
 
 
808 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.65 
 
 
804 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 
808 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 
862 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.65 
 
 
802 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.73 
 
 
797 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.94 
 
 
804 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.93 
 
 
883 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.89 
 
 
805 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.97 
 
 
816 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.41 
 
 
819 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.44 
 
 
887 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.24 
 
 
865 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.85 
 
 
845 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.1 
 
 
817 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.79 
 
 
855 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  35.81 
 
 
806 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32 
 
 
808 aa  357  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.27 
 
 
844 aa  357  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.67 
 
 
874 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.17 
 
 
809 aa  354  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  33.21 
 
 
808 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.29 
 
 
849 aa  353  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  34.03 
 
 
843 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.76 
 
 
817 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.21 
 
 
811 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.7 
 
 
803 aa  343  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.33 
 
 
913 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.47 
 
 
812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.65 
 
 
810 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 
810 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  34.7 
 
 
810 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.19 
 
 
879 aa  323  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 
919 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  33.91 
 
 
835 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.7 
 
 
887 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  33.99 
 
 
819 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.42 
 
 
848 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 
884 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.24 
 
 
861 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.81 
 
 
888 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.51 
 
 
803 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.62 
 
 
880 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 
813 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.78 
 
 
844 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 
820 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 
810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 
809 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.32 
 
 
846 aa  271  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.57 
 
 
810 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.52 
 
 
807 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.55 
 
 
828 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.22 
 
 
931 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 
795 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 
802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
798 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 
810 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
790 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 
813 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 
800 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
811 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
817 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
805 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 
800 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 
793 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
800 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 
788 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 
798 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 
795 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>