More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3340 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  46.12 
 
 
757 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  45.97 
 
 
758 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  46.16 
 
 
768 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  48.1 
 
 
693 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
692 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  52.23 
 
 
836 aa  727    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  45.18 
 
 
765 aa  659    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  46.1 
 
 
851 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  45.95 
 
 
751 aa  653    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
692 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
692 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
692 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  53.55 
 
 
780 aa  736    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  48.04 
 
 
702 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  45.85 
 
 
758 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  50.4 
 
 
711 aa  694    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.66 
 
 
841 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  45.53 
 
 
758 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  45.99 
 
 
747 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
692 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  48.98 
 
 
831 aa  716    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  48.17 
 
 
697 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  46.95 
 
 
831 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  47.34 
 
 
691 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  47.25 
 
 
692 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  46.85 
 
 
696 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  47.54 
 
 
746 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  47.52 
 
 
692 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
692 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  45.4 
 
 
779 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  50.45 
 
 
813 aa  744    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  100 
 
 
853 aa  1763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  53.04 
 
 
789 aa  730    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  46.56 
 
 
756 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  45.98 
 
 
710 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
692 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
692 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  46.1 
 
 
851 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  51.62 
 
 
793 aa  770    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  48.15 
 
 
767 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  43.41 
 
 
783 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  45.49 
 
 
765 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
692 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  45.88 
 
 
776 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  49.68 
 
 
894 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  48.85 
 
 
831 aa  714    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  46.89 
 
 
703 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  46.61 
 
 
758 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  43.27 
 
 
706 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 
779 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  47.51 
 
 
748 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  46.39 
 
 
695 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  46.79 
 
 
697 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  46.59 
 
 
804 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  45.5 
 
 
798 aa  628  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  45.27 
 
 
802 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  47.12 
 
 
703 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  47.51 
 
 
693 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  46.14 
 
 
711 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  47.12 
 
 
691 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  44.6 
 
 
760 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  44 
 
 
836 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  47.55 
 
 
703 aa  619  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  46.11 
 
 
700 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  45.84 
 
 
700 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  43.48 
 
 
694 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 
759 aa  615  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 
759 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  46.48 
 
 
706 aa  609  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  45.3 
 
 
798 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 
859 aa  609  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  45.8 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  45.8 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  44.31 
 
 
798 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  46.69 
 
 
693 aa  608  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  43.61 
 
 
696 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  46.35 
 
 
691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  45.53 
 
 
689 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  45.37 
 
 
798 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  46.01 
 
 
714 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  45.23 
 
 
708 aa  600  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  43.84 
 
 
765 aa  595  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  45.72 
 
 
706 aa  593  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  42.66 
 
 
743 aa  588  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  42.74 
 
 
799 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  43.84 
 
 
865 aa  579  1e-164  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 
834 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  42.28 
 
 
868 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 
879 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  41.25 
 
 
870 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  41.33 
 
 
876 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 
696 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 
684 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  40.89 
 
 
869 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  40.89 
 
 
869 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  40.89 
 
 
869 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  40.78 
 
 
868 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  40.64 
 
 
877 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  45.36 
 
 
694 aa  567  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  44.69 
 
 
686 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>