More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3311 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  100 
 
 		 324 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  51.02 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  36.96 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  37.21 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  38.01 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.21 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  36.44 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  36.8 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.86 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  34.15 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  36.22 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  34.91 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 379 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.54 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.03 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.85 
 
 		 175 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 387 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.62 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 205 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.4 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.55 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  28.77 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  33.82 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.09 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.78 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 508 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.21 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  31.22 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  27.27 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.64 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.27 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  26.7 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  27.7 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.64 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.27 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.82 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  38.97 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  27.5 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  38.33 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.56 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.96 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.91 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  27.5 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.95 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.44 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 178 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.58 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  31.38 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  32.6 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  29.88 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.58 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>