More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3281 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  37.67 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.19 
 
 
173 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  38.46 
 
 
162 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  42.96 
 
 
160 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.49 
 
 
184 aa  98.6  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  40.3 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.3 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  39.57 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.24 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  34.03 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  34.27 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.57 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.01 
 
 
157 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  35.51 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  34.29 
 
 
157 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 
161 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
150 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.86 
 
 
152 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.86 
 
 
152 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.92 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  35.92 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  33.57 
 
 
187 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.35 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.71 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.68 
 
 
152 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.68 
 
 
152 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
153 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.68 
 
 
152 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.68 
 
 
152 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  87  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  38.4 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  43.12 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  32.87 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.04 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  36.99 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  43.52 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  39.82 
 
 
157 aa  84.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  37.69 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.09 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.09 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.15 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  30.14 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  37.82 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36.15 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  36.64 
 
 
160 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.67 
 
 
161 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.88 
 
 
152 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  40.34 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  41.38 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  39.32 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  44.95 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  42.11 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  36.96 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.04 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.03 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  39.34 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.11 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.54 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  39.64 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  39.47 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  39.83 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.07 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  41.96 
 
 
497 aa  81.6  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  39.64 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  35.77 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  31.69 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  38.94 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  41.35 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.38 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  39.64 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  47.12 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  38.24 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  38.6 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  41.59 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  36.75 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  34.06 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  38.79 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  35.66 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.88 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  40 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  34.68 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  37.84 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  41.07 
 
 
174 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  31.69 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  41.53 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  39.5 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  34.68 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  39.42 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  41.12 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>