58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3249 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 
445 aa  923  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  46.88 
 
 
433 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  44.16 
 
 
446 aa  356  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  46.8 
 
 
587 aa  353  3e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  43.69 
 
 
453 aa  329  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  45.41 
 
 
427 aa  327  2e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  43.45 
 
 
424 aa  322  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  43.3 
 
 
450 aa  315  1e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.66 
 
 
435 aa  309  7e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  2.26064e-06  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  41.95 
 
 
442 aa  306  5e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  41.97 
 
 
440 aa  305  1e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  42.17 
 
 
445 aa  285  2e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  42.27 
 
 
469 aa  270  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  31.89 
 
 
737 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  31.89 
 
 
533 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.84 
 
 
583 aa  180  5e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.36 
 
 
387 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  30.97 
 
 
535 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  30.28 
 
 
568 aa  175  1e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  31.41 
 
 
532 aa  175  1e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  30.73 
 
 
471 aa  174  3e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.58 
 
 
589 aa  174  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  31.57 
 
 
407 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  30.21 
 
 
535 aa  173  6e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86405e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  28.67 
 
 
604 aa  173  7e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 
441 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  29.03 
 
 
408 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  31.03 
 
 
612 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.14 
 
 
548 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  28.78 
 
 
597 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  28.23 
 
 
399 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  6.54104e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  28.64 
 
 
403 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  29.01 
 
 
411 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  28.79 
 
 
408 aa  149  1e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.5241e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  28.73 
 
 
677 aa  149  1e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  30.63 
 
 
693 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.72 
 
 
558 aa  142  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  28.73 
 
 
541 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  29.7 
 
 
535 aa  140  5e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  29.11 
 
 
658 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  27.83 
 
 
413 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  27.58 
 
 
727 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  26.52 
 
 
547 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  26.95 
 
 
567 aa  118  2e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  25.61 
 
 
850 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  25.78 
 
 
574 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.88 
 
 
636 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.32 
 
 
631 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.89 
 
 
320 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.46 
 
 
640 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  24.56 
 
 
434 aa  73.6  7e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  22.77 
 
 
469 aa  65.1  2e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  30.17 
 
 
684 aa  55.8  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  30 
 
 
683 aa  55.1  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  20.87 
 
 
1172 aa  54.3  4e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  33.94 
 
 
657 aa  52  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.38 
 
 
824 aa  50.4  6e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.68 
 
 
505 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>