More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3243 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  42.57 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  39.46 
 
 
226 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  41.13 
 
 
204 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.14 
 
 
231 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.23 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.51 
 
 
213 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.59 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  37.97 
 
 
173 aa  114  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.85 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  39.73 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  42.21 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  41.67 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 
209 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.16 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.64 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.72 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  36.11 
 
 
225 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  40 
 
 
221 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  41.86 
 
 
194 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.67 
 
 
185 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.92 
 
 
210 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.93 
 
 
217 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.65 
 
 
260 aa  104  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 
239 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
204 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.19 
 
 
198 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.85 
 
 
274 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 
248 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 
239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.07 
 
 
223 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  34.15 
 
 
184 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  38.22 
 
 
210 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 
239 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  37.41 
 
 
174 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 
247 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
207 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
178 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.88 
 
 
192 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  34.08 
 
 
181 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
185 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  42.11 
 
 
201 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
203 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.88 
 
 
192 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.78 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 
237 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.81 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.53 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  35.51 
 
 
210 aa  98.6  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 
206 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
242 aa  98.2  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  37.42 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  34.25 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.24 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
241 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
250 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
259 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  37.58 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  32.85 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
259 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  37.58 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  36.51 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  35.44 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  40 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  36.67 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  38 
 
 
265 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>