248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3056 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 
418 aa  830  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  45.26 
 
 
408 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  50.12 
 
 
432 aa  365  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  45.02 
 
 
408 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.65 
 
 
432 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.77 
 
 
440 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.28 
 
 
412 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  43.09 
 
 
420 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  45.41 
 
 
409 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.15 
 
 
413 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  42.89 
 
 
403 aa  342  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  46.13 
 
 
408 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  43.85 
 
 
420 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  43.85 
 
 
420 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  42.69 
 
 
403 aa  339  6e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.27 
 
 
406 aa  338  1e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  43.72 
 
 
419 aa  337  3e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  42.21 
 
 
403 aa  337  3e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  44.81 
 
 
414 aa  336  4e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  42.45 
 
 
403 aa  336  6e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  42.79 
 
 
427 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  43.68 
 
 
402 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  41.97 
 
 
402 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  45.11 
 
 
417 aa  330  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  43.65 
 
 
414 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  43.28 
 
 
404 aa  328  1e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  43.17 
 
 
402 aa  328  1e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  42.51 
 
 
403 aa  328  1e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  41.41 
 
 
419 aa  327  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  43.68 
 
 
427 aa  322  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  41.49 
 
 
402 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  43.1 
 
 
417 aa  322  1e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  40.51 
 
 
422 aa  321  2e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  41.97 
 
 
402 aa  321  2e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  43.72 
 
 
419 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.11 
 
 
459 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  42.36 
 
 
419 aa  319  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  43.55 
 
 
427 aa  319  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  43.26 
 
 
419 aa  319  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  42.33 
 
 
419 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  43.02 
 
 
419 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  43.52 
 
 
418 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  43.26 
 
 
419 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  38.94 
 
 
422 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  42.36 
 
 
419 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  42.89 
 
 
405 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  43.33 
 
 
419 aa  314  2e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  40.48 
 
 
402 aa  314  2e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  40.98 
 
 
425 aa  314  2e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  43.06 
 
 
425 aa  313  3e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  40.48 
 
 
402 aa  313  3e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  41.76 
 
 
432 aa  313  3e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  41.44 
 
 
419 aa  313  5e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  41.93 
 
 
403 aa  312  6e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40053e-08  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  40.98 
 
 
425 aa  312  8e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.24 
 
 
402 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  40.24 
 
 
402 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  43.59 
 
 
423 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  43.59 
 
 
423 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.1013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.39018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  41.59 
 
 
419 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.01622e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  43.59 
 
 
423 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.07855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.52 
 
 
418 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  41.2 
 
 
403 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  40.92 
 
 
402 aa  310  3e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  41.51 
 
 
413 aa  308  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.79 
 
 
475 aa  306  4e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  42.21 
 
 
401 aa  305  1e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  41.12 
 
 
585 aa  305  1e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  41.63 
 
 
419 aa  304  2e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  42.09 
 
 
419 aa  304  2e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  41.63 
 
 
419 aa  304  2e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  38.71 
 
 
422 aa  304  2e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  43.21 
 
 
443 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  39.68 
 
 
424 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  38.8 
 
 
426 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  41.06 
 
 
403 aa  300  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  40.14 
 
 
399 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  38.8 
 
 
424 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  38.8 
 
 
424 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  38.8 
 
 
424 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  38.8 
 
 
424 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.13 
 
 
416 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  42.72 
 
 
416 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  38.84 
 
 
566 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  41.94 
 
 
420 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  41.44 
 
 
425 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.57 
 
 
416 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  38.57 
 
 
424 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  40.96 
 
 
408 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  37.65 
 
 
406 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  38.22 
 
 
401 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  41.2 
 
 
425 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2071  Na+ dependent nucleoside transporter  37.83 
 
 
400 aa  287  3e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.626229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  39.66 
 
 
424 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  39.66 
 
 
424 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>