More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3042 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
380 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.18 
 
 
425 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.69 
 
 
282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.62 
 
 
261 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.43 
 
 
265 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
277 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 
292 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 
282 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.11 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
275 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
262 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
279 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.84 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.84 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
256 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
256 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
256 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
259 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
261 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
259 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
263 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  31.93 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.77 
 
 
279 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
282 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.32 
 
 
263 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
262 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 
264 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
268 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.12 
 
 
264 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.45 
 
 
263 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.88 
 
 
259 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 
256 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
263 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
256 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
397 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  44.35 
 
 
130 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
256 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
265 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
275 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
263 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 
258 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
263 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
275 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
136 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  28.77 
 
 
263 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 
266 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
263 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  26.29 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 
251 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
226 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.61 
 
 
392 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 
265 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 
263 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
256 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 
265 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
263 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
269 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
254 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
271 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
266 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.71 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.31 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.31 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  29.02 
 
 
262 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.71 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.31 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
122 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.31 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 
262 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.37 
 
 
262 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.51 
 
 
262 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
134 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  31 
 
 
393 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 
393 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
266 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
270 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.08 
 
 
263 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
265 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  28.45 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
133 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  25.43 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  24.89 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  25.43 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  25.43 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>