More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3041 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
844 aa  1716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  49.35 
 
 
919 aa  744    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  47.88 
 
 
849 aa  813    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.12 
 
 
874 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.78 
 
 
915 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.64 
 
 
855 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 
913 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32.64 
 
 
814 aa  360  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.27 
 
 
817 aa  357  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.14 
 
 
822 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 
805 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.99 
 
 
888 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 
805 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  31.89 
 
 
797 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  31.4 
 
 
796 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 
807 aa  333  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.92 
 
 
813 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.39 
 
 
823 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.67 
 
 
809 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.98 
 
 
882 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.27 
 
 
811 aa  323  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 
816 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.85 
 
 
809 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.51 
 
 
804 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.45 
 
 
831 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.19 
 
 
805 aa  317  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  29.02 
 
 
802 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.6 
 
 
804 aa  314  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  29.69 
 
 
810 aa  314  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.5 
 
 
817 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.42 
 
 
798 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.42 
 
 
807 aa  310  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.73 
 
 
805 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  31.37 
 
 
808 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.73 
 
 
871 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.42 
 
 
844 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.4 
 
 
878 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.24 
 
 
817 aa  303  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  28.87 
 
 
821 aa  303  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  31.39 
 
 
808 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  29.72 
 
 
869 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  27.9 
 
 
845 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 
821 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  30.48 
 
 
809 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 
805 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  28.16 
 
 
805 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  31 
 
 
803 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  30.47 
 
 
808 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.47 
 
 
883 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.31 
 
 
861 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.41 
 
 
893 aa  287  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.37 
 
 
848 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.71 
 
 
803 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.77 
 
 
880 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  29.91 
 
 
887 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.66 
 
 
846 aa  278  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.12 
 
 
862 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.32 
 
 
810 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.08 
 
 
812 aa  270  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.86 
 
 
884 aa  270  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  29.44 
 
 
806 aa  263  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.39 
 
 
803 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  27.78 
 
 
865 aa  260  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  29.3 
 
 
816 aa  256  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 
828 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  27.83 
 
 
887 aa  254  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  28.6 
 
 
843 aa  254  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  29.56 
 
 
819 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.18 
 
 
819 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  29.27 
 
 
800 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.17 
 
 
808 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.65 
 
 
879 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  28.06 
 
 
810 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  28.03 
 
 
808 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
813 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 
809 aa  235  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  29.94 
 
 
835 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.34 
 
 
807 aa  233  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.29 
 
 
820 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
810 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.68 
 
 
810 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.19 
 
 
931 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
797 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 
810 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
788 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 
770 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
784 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
791 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
818 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
793 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
805 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 
800 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 
793 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
777 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 
816 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 
784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
792 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
798 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 
798 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 
811 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>