More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2994 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  41.98 
 
 
259 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  43.87 
 
 
226 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  43.61 
 
 
234 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  42.22 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  39.26 
 
 
262 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  39.07 
 
 
209 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  39.07 
 
 
209 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  38.25 
 
 
209 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  36.53 
 
 
305 aa  174  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  41.35 
 
 
224 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  41.1 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  41.1 
 
 
234 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  40.54 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  38.68 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  37.09 
 
 
215 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  34.26 
 
 
225 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  41.59 
 
 
196 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  35.85 
 
 
219 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  35.32 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  35.32 
 
 
229 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 
215 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  38.25 
 
 
209 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  38.73 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  38.58 
 
 
199 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  35.75 
 
 
229 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  35.59 
 
 
211 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  33.05 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.07 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35.68 
 
 
832 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  31.76 
 
 
239 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  35.15 
 
 
200 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  36.32 
 
 
825 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  33.64 
 
 
201 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 
239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  34.47 
 
 
200 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  32.08 
 
 
241 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.14 
 
 
204 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.08 
 
 
240 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  34.36 
 
 
200 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  27.94 
 
 
208 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  31 
 
 
240 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  29.08 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  32.88 
 
 
819 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.8 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  32.35 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.67 
 
 
202 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 
203 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  32.49 
 
 
827 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  25.45 
 
 
214 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  28.72 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.9 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  31.36 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  31.53 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  30.58 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  29.23 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  32.2 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.65 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.65 
 
 
206 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  29.65 
 
 
206 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.65 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.56 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  28.63 
 
 
210 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  26.91 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  27.43 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.91 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.23 
 
 
206 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  27.91 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 
197 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  27.59 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.96 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  30.97 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.96 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  30.67 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  29.15 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 
283 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  29.23 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.8 
 
 
207 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  27.09 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.02 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  28.91 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  28.64 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  28.64 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  28.94 
 
 
234 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.56 
 
 
210 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  28.44 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.43 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  28.44 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  29.33 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  32.88 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.55 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>