More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2987 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  60.76 
 
 
500 aa  653  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  61.17 
 
 
503 aa  648  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  61.77 
 
 
505 aa  661  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  63.08 
 
 
496 aa  644  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.21066e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  60.97 
 
 
500 aa  653  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  61.37 
 
 
500 aa  650  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  62.15 
 
 
501 aa  636  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  61.17 
 
 
518 aa  649  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  62.58 
 
 
499 aa  660  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  61.17 
 
 
518 aa  649  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  61.17 
 
 
518 aa  649  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  61.17 
 
 
518 aa  649  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  61.17 
 
 
518 aa  649  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  100 
 
 
498 aa  1014  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  64.91 
 
 
505 aa  665  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  62.07 
 
 
513 aa  657  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5647e-05 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  60.97 
 
 
500 aa  653  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  61.69 
 
 
496 aa  644  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  62.83 
 
 
496 aa  651  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  60.97 
 
 
500 aa  653  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  60.97 
 
 
500 aa  654  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  64.24 
 
 
496 aa  656  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  61.17 
 
 
503 aa  648  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  61.69 
 
 
496 aa  645  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  61.37 
 
 
500 aa  657  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  62.45 
 
 
499 aa  657  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  62.17 
 
 
499 aa  659  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  60.24 
 
 
494 aa  628  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  61.77 
 
 
496 aa  630  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  60.36 
 
 
520 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.12542e-06  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  59.43 
 
 
497 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  60.53 
 
 
497 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  60.65 
 
 
497 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  60.45 
 
 
494 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  58.22 
 
 
498 aa  625  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  60.45 
 
 
494 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  60.45 
 
 
494 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  60.04 
 
 
494 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  59.07 
 
 
502 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  3.11367e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  60.24 
 
 
494 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  60.24 
 
 
494 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35699e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  60.04 
 
 
494 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  60.24 
 
 
494 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  59.07 
 
 
507 aa  618  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  59.48 
 
 
502 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  59.48 
 
 
502 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  59.48 
 
 
502 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  59.07 
 
 
507 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  59.48 
 
 
502 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  59.27 
 
 
502 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  59.07 
 
 
507 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  59.07 
 
 
503 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  58.62 
 
 
494 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  59.68 
 
 
503 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.30334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  59.63 
 
 
497 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  59.07 
 
 
502 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  59.15 
 
 
507 aa  617  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  59.76 
 
 
498 aa  611  1e-174  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  614  1e-174  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  57.61 
 
 
496 aa  613  1e-174  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.69449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  57.61 
 
 
496 aa  612  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  57.61 
 
 
496 aa  611  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.10223e-06  decreased coverage  9.61259e-09 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  614  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  59.07 
 
 
503 aa  612  1e-174  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  60.57 
 
 
510 aa  613  1e-174  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  59.43 
 
 
499 aa  612  1e-174  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  613  1e-174  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.62863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  58.01 
 
 
496 aa  614  1e-174  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.37015e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  59.15 
 
 
501 aa  611  1e-174  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  59.68 
 
 
505 aa  614  1e-174  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  59.67 
 
 
500 aa  612  1e-174  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  57.46 
 
 
501 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  59.03 
 
 
498 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  59.03 
 
 
499 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  59.23 
 
 
499 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  57.4 
 
 
496 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.15642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  59.27 
 
 
495 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  57.66 
 
 
500 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  58.47 
 
 
502 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  58.67 
 
 
502 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  59.72 
 
 
505 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  60.25 
 
 
498 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  59.92 
 
 
496 aa  608  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  57.26 
 
 
500 aa  607  1e-172  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  58.27 
 
 
504 aa  605  1e-172  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  59.23 
 
 
501 aa  607  1e-172  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  57.11 
 
 
499 aa  607  1e-172  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  58.87 
 
 
503 aa  607  1e-172  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  58.74 
 
 
501 aa  606  1e-172  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  59.31 
 
 
505 aa  604  1e-172  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  58.59 
 
 
502 aa  607  1e-172  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>