More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2957 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
150 aa  315  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  60.61 
 
 
139 aa  166  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.36 
 
 
143 aa  163  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.28 
 
 
152 aa  153  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  52.78 
 
 
148 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  49.28 
 
 
150 aa  150  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.26 
 
 
144 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  52.27 
 
 
138 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  52.99 
 
 
164 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.99 
 
 
139 aa  146  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  53.96 
 
 
144 aa  146  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  51.47 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.45 
 
 
140 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 
143 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  45.71 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.75 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  53.85 
 
 
132 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.38 
 
 
137 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.77 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.93 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  51.45 
 
 
151 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  51.06 
 
 
148 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
142 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  52.31 
 
 
138 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  52.99 
 
 
140 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.37 
 
 
137 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 
143 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50 
 
 
137 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  53.03 
 
 
142 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 
144 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
144 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  50.76 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  52.38 
 
 
140 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 
145 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.2 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.49 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  54.39 
 
 
258 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.85 
 
 
141 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  45.93 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.99 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
258 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
140 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
254 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
255 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.76 
 
 
139 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 
154 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
148 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  44.96 
 
 
144 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  47.48 
 
 
143 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
145 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  44.36 
 
 
254 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  48.33 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  45.86 
 
 
299 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.11 
 
 
299 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.11 
 
 
270 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
276 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
165 aa  114  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
151 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.15 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
257 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.29 
 
 
164 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
146 aa  110  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  41.67 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  42.42 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.19 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 
164 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  46.04 
 
 
498 aa  107  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
138 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
138 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  41.54 
 
 
138 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.38 
 
 
287 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 
170 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  43.8 
 
 
153 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  45.69 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 
287 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  41.35 
 
 
162 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
175 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
164 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 
171 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
164 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
164 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  41.04 
 
 
134 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  41.04 
 
 
134 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  41.43 
 
 
165 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 
142 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>