135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2822 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  43.6 
 
 
274 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  32.03 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  34.93 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  33.03 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  31.27 
 
 
259 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  31.27 
 
 
259 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  31.27 
 
 
259 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  31.27 
 
 
259 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  30.89 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  32.49 
 
 
257 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  29.92 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  33.04 
 
 
252 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  28.73 
 
 
263 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  31.6 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  29.92 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  28.74 
 
 
261 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  28.94 
 
 
264 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  31.56 
 
 
258 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  31.15 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  32.47 
 
 
261 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  30.74 
 
 
265 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  32.16 
 
 
266 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  30.74 
 
 
257 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  31.88 
 
 
258 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  29.6 
 
 
259 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  31.51 
 
 
265 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  29.44 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  32.62 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  27.54 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.57 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  29.68 
 
 
234 aa  99  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  30.67 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.57 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  28.83 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  28.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  28.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  29.44 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  30.3 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  28.35 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  28.35 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  0.0000000053706 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  32.02 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  30.3 
 
 
269 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  29.61 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.98 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  29.95 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  29.25 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  34.09 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  30.74 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  26.77 
 
 
265 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  29.87 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  31.07 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  26.89 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  31.71 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  32.23 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  26.34 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  31.46 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3011  hypothetical protein  33.66 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000384912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  25.95 
 
 
267 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  26.61 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  30.63 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  28.95 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  31.69 
 
 
258 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  26.87 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  30.1 
 
 
247 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  28.46 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  37.9 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  29.61 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  31.36 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>