More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2803 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
398 aa  799    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  55.03 
 
 
429 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  54 
 
 
404 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  54.52 
 
 
429 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  54.27 
 
 
410 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  54.02 
 
 
418 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  54.27 
 
 
418 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
404 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  53.23 
 
 
405 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  50.87 
 
 
404 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  51.75 
 
 
404 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
410 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  52.25 
 
 
404 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  51.74 
 
 
404 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  52.01 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  52.5 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  53.09 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  49.88 
 
 
408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  52 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  51 
 
 
406 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  50.13 
 
 
412 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
438 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  48.88 
 
 
410 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  50.5 
 
 
405 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 
405 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
405 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  47.98 
 
 
413 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  47.77 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.36 
 
 
398 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.77 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  41.96 
 
 
407 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 
406 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  41.79 
 
 
420 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.06 
 
 
432 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  37.66 
 
 
409 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.07 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  36.39 
 
 
409 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  40.81 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  38.62 
 
 
421 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  35.88 
 
 
400 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 
400 aa  226  6e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 
400 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
419 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 
435 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  36.22 
 
 
414 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  35.99 
 
 
406 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  36.06 
 
 
410 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.78 
 
 
281 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  37.28 
 
 
410 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  38.36 
 
 
417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  38.36 
 
 
417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  38.36 
 
 
417 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  45.96 
 
 
303 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  36.6 
 
 
419 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
306 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
306 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  42.68 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  36.41 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 
295 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.88 
 
 
279 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 
325 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 
307 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  43.63 
 
 
295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  43.63 
 
 
295 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  42.24 
 
 
279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 
295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  43.14 
 
 
295 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 
326 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 
568 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
454 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  41.92 
 
 
275 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.57 
 
 
279 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  42.62 
 
 
317 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
281 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 
213 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.98 
 
 
281 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  43.83 
 
 
284 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  45.74 
 
 
297 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  44.58 
 
 
291 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  44.17 
 
 
213 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  44.68 
 
 
296 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  43.33 
 
 
285 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>