More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2787 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 
290 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  41.39 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  39.43 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 
227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 
243 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  36.68 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 
269 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  33.21 
 
 
263 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  33.76 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  36.2 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  34.45 
 
 
263 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
292 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  37.07 
 
 
270 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.2 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  34.78 
 
 
241 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
251 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
275 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  37.68 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  33.68 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  31.45 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  36.13 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  32.46 
 
 
263 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
237 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.63 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  32.31 
 
 
238 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  32.31 
 
 
238 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  33.74 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  36.16 
 
 
237 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 
295 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
291 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  33.77 
 
 
264 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  33.08 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  32.69 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.67 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.36 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  31.05 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  36.71 
 
 
238 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  36.71 
 
 
238 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  32.58 
 
 
235 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  30.92 
 
 
260 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  29.18 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  30.2 
 
 
262 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
237 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  32.22 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  33.07 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  31.06 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.63 
 
 
291 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.63 
 
 
291 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.63 
 
 
291 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.63 
 
 
291 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 
237 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
287 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
258 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  30.8 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  30.68 
 
 
268 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 
298 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  34.03 
 
 
242 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  29.35 
 
 
276 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
291 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
273 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  34.07 
 
 
240 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  34.2 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.17 
 
 
324 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 
295 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
290 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  30.8 
 
 
271 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 
279 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
271 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  30.4 
 
 
269 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
269 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
235 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>