More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2757 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
413 aa  834    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  62.93 
 
 
412 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.52 
 
 
419 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 
416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33.49 
 
 
405 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.05 
 
 
409 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
410 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
416 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
405 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  35.7 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.04 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  35.76 
 
 
414 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 
409 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  30.42 
 
 
419 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
409 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
414 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.31 
 
 
391 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.85 
 
 
409 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
654 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  33.02 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.93 
 
 
409 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.66 
 
 
653 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  32.6 
 
 
657 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  32.77 
 
 
403 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.94 
 
 
414 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 
401 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
405 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.35 
 
 
410 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.49 
 
 
407 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.19 
 
 
647 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
405 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 
656 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  32.04 
 
 
398 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.82 
 
 
656 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.35 
 
 
410 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
415 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  32.55 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  31.74 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  31.63 
 
 
657 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.86 
 
 
682 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
410 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
406 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  30.86 
 
 
682 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  30.75 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.86 
 
 
667 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  30.86 
 
 
667 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.59 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
405 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
405 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
392 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  30.21 
 
 
421 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.81 
 
 
402 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.43 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.64 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.58 
 
 
399 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  33.1 
 
 
412 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.93 
 
 
656 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.37 
 
 
415 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.97 
 
 
403 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  29.72 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  31.31 
 
 
648 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  31.31 
 
 
648 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
402 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.7 
 
 
409 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.7 
 
 
409 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.83 
 
 
402 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.68 
 
 
657 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 
658 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.81 
 
 
443 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  32.62 
 
 
656 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
406 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  31.98 
 
 
663 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  28.25 
 
 
456 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  29.79 
 
 
414 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
649 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.2 
 
 
394 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.4 
 
 
402 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.17 
 
 
400 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
400 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.9 
 
 
657 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 
406 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  30.88 
 
 
653 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  31.15 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
402 aa  167  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.85 
 
 
653 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  31.15 
 
 
404 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  29.95 
 
 
668 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  29.95 
 
 
668 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.71 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  29.9 
 
 
423 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.67 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.83 
 
 
657 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  32.85 
 
 
654 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  31.5 
 
 
663 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>