33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2681 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  100 
 
 
325 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  29.83 
 
 
320 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  28.53 
 
 
319 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  27.74 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  28.45 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  28.12 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  28.67 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  28.52 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  26.32 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  25.47 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.19 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01706  glutaminyl cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08280)  26.59 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.592246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  25.45 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02870  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  29.53 
 
 
616 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  31.45 
 
 
347 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  26.92 
 
 
391 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.29 
 
 
574 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  25.96 
 
 
584 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  24.75 
 
 
794 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.06 
 
 
1077 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.49 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  29.57 
 
 
373 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  26.41 
 
 
512 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  28.12 
 
 
815 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.51 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  40.85 
 
 
771 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  26.99 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.07 
 
 
394 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  32.74 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  23.77 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.46 
 
 
454 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>