More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2680 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.8 
 
 
264 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.06 
 
 
324 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.91 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.76 
 
 
257 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.15 
 
 
468 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  42.56 
 
 
270 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.15 
 
 
268 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.15 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.3 
 
 
252 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.25 
 
 
270 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  36.61 
 
 
247 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37.14 
 
 
251 aa  171  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  37.45 
 
 
250 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37.55 
 
 
247 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.48 
 
 
259 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.96 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 
250 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  35.6 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.04 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  34.72 
 
 
263 aa  161  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  37.92 
 
 
249 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0075  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.23 
 
 
324 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.54 
 
 
253 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  35.5 
 
 
368 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  37.18 
 
 
250 aa  159  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.73 
 
 
275 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  38.22 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  31.91 
 
 
323 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.8 
 
 
241 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.75 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.18 
 
 
272 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  32.37 
 
 
247 aa  152  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.11 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.63 
 
 
263 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  34.3 
 
 
245 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  33.88 
 
 
245 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  34.3 
 
 
245 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  37.02 
 
 
256 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.81 
 
 
277 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.94 
 
 
241 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.68 
 
 
246 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  32.82 
 
 
270 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
268 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  30.2 
 
 
268 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.16 
 
 
249 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.61 
 
 
278 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  34.4 
 
 
253 aa  141  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  35.22 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.81 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.65 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  35.32 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  33.83 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.92 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
249 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  35.27 
 
 
283 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  32.77 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1486  MttB family protein  31.88 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  32.93 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
247 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  32.89 
 
 
230 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.05 
 
 
278 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000498053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.75 
 
 
321 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.89 
 
 
242 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  31.88 
 
 
281 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.95 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  32.92 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  29.59 
 
 
330 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.13 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  34.23 
 
 
262 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.23 
 
 
262 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.84 
 
 
253 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.6 
 
 
280 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.01 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.11 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.01 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  28.87 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  33.74 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.89 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.11 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.84 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.18 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.16 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  32.79 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.2 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.28 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.13 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.1 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.45 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.25 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  31.25 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.38 
 
 
316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.87 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  29.41 
 
 
266 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.61 
 
 
242 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>