138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2675 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1188 aa  2441    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1120 aa  227  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1075 aa  152  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1041 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  32.06 
 
 		 1195 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 1176 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1122 aa  138  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1126 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1054 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1125 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 1167 aa  133  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 1114 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  29.68 
 
 		 1162 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.29 
 
 		 986 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1149 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1109 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 1105 aa  125  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  31 
 
 		 1075 aa  125  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1123 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1232 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 1105 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1069 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.31 
 
 		 1203 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1161 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1123 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29.88 
 
 		 1298 aa  111  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  24.16 
 
 		 1194 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 1124 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 1065 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1141 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 1007 aa  107  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  30.88 
 
 		 1210 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.59 
 
 		 1050 aa  104  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1132 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1153 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 972 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 1066 aa  102  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 991 aa  101  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1196 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25 
 
 		 1257 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1162 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 993 aa  99  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1173 aa  98.2  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  28.7 
 
 		 979 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.47 
 
 		 1001 aa  97.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1066 aa  96.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.85 
 
 		 511 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.3 
 
 		 966 aa  92.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.32 
 
 		 1037 aa  91.3  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1194 aa  88.2  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.88 
 
 		 1056 aa  87.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1074 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1007 aa  87  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.1 
 
 		 994 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1097 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.42 
 
 		 1068 aa  83.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.52 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 1007 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.27 
 
 		 1066 aa  81.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1089 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.46 
 
 		 997 aa  79  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1052 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.51 
 
 		 1116 aa  77.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1067 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1077 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.43 
 
 		 992 aa  75.1  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1053 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  23.91 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1071 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.05 
 
 		 1061 aa  72.4  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 952 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.24 
 
 		 1057 aa  68.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1008 aa  67.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.68 
 
 		 1051 aa  67.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27 
 
 		 1041 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 1087 aa  67.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 1100 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 1010 aa  66.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 935 aa  65.1  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1066 aa  64.7  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.82 
 
 		 1125 aa  64.7  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.14 
 
 		 1010 aa  64.3  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1074 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1008 aa  63.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1129 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1071 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 871 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 798 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.51 
 
 		 1008 aa  61.6  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.03 
 
 		 800 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 866 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 1016 aa  58.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  20.24 
 
 		 1008 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 791 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 932 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>