106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2674 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 1132 aa  2292    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1069 aa  295  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1176 aa  290  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1105 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1123 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1167 aa  269  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1162 aa  268  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1075 aa  267  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1149 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1065 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.11 
 
 		 1195 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1123 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1161 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1114 aa  248  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1153 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1141 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.39 
 
 		 1203 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1173 aa  227  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 1206 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.85 
 
 		 1210 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1124 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1122 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1257 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1125 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 1232 aa  161  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  24.81 
 
 		 1298 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31.05 
 
 		 1194 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 1041 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1075 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1105 aa  139  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  23.36 
 
 		 1162 aa  137  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.3 
 
 		 1068 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  30.16 
 
 		 986 aa  129  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.61 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1196 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.4 
 
 		 1125 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  21.88 
 
 		 979 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1188 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1097 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  25 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1105 aa  96.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1067 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1071 aa  92  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1053 aa  91.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1008 aa  89.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1126 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1008 aa  88.2  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  26.32 
 
 		 1051 aa  87.4  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.91 
 
 		 1056 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 991 aa  86.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.43 
 
 		 1010 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1120 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1122 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1109 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1194 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1010 aa  79.7  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.64 
 
 		 1008 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.38 
 
 		 992 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1052 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  27.27 
 
 		 1081 aa  76.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1066 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 972 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1068 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.18 
 
 		 966 aa  72  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 1026 aa  70.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25 
 
 		 1057 aa  68.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1074 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1016 aa  66.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.32 
 
 		 1050 aa  65.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 1054 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 1007 aa  65.1  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 866 aa  65.1  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1077 aa  65.1  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.79 
 
 		 1061 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 993 aa  64.3  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1007 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1066 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  25 
 
 		 1129 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 1116 aa  62  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.3 
 
 		 1066 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  26.3 
 
 		 1041 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1100 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  30 
 
 		 1071 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  25 
 
 		 1012 aa  56.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1007 aa  56.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 833 aa  55.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1008 aa  53.5  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.18 
 
 		 1037 aa  53.5  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 749 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 888 aa  52  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 943 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.27 
 
 		 997 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.29 
 
 		 994 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1089 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.09 
 
 		 1001 aa  48.9  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1004 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 795 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>