More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2660 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  58.16 
 
 
586 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  57.48 
 
 
586 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  57.14 
 
 
596 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  56.85 
 
 
588 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  56.56 
 
 
590 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  100 
 
 
581 aa  1191    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  36.38 
 
 
549 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  31.63 
 
 
586 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.21 
 
 
390 aa  217  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.83 
 
 
353 aa  203  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.36 
 
 
412 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.43 
 
 
687 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.37 
 
 
681 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.7 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.26 
 
 
690 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.43 
 
 
700 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  34.74 
 
 
676 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.54 
 
 
687 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.58 
 
 
684 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  31.03 
 
 
691 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 
676 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  32.95 
 
 
674 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.06 
 
 
713 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.54 
 
 
678 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.67 
 
 
684 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.34 
 
 
1138 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.55 
 
 
678 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  40.95 
 
 
211 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  38.81 
 
 
229 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  38.14 
 
 
228 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.79 
 
 
682 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.24 
 
 
686 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  37.55 
 
 
248 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.84 
 
 
692 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.84 
 
 
692 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  37.55 
 
 
248 aa  170  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.78 
 
 
678 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.8 
 
 
689 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  38.14 
 
 
228 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  35.69 
 
 
411 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  36.2 
 
 
229 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  35.8 
 
 
394 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  40.8 
 
 
409 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.06 
 
 
669 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.48 
 
 
402 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.52 
 
 
675 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  40.16 
 
 
403 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.35 
 
 
403 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.23 
 
 
691 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.61 
 
 
670 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  31.7 
 
 
820 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 
1155 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  34.68 
 
 
402 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  39.51 
 
 
402 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  34.98 
 
 
394 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.23 
 
 
668 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.56 
 
 
625 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  33.47 
 
 
402 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  37.86 
 
 
397 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  33.74 
 
 
396 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 
396 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.4 
 
 
408 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  37.45 
 
 
397 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  33.47 
 
 
402 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.71 
 
 
402 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  36.76 
 
 
414 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  35.71 
 
 
402 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  37.04 
 
 
397 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  29.32 
 
 
711 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  37.04 
 
 
397 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.21 
 
 
702 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  29.08 
 
 
1142 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  38.15 
 
 
409 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  37.04 
 
 
397 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.02 
 
 
597 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2442  MOSC domain-containing protein  38.57 
 
 
211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000472936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  35.39 
 
 
396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  34.19 
 
 
414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  35.39 
 
 
396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  36.11 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  36.11 
 
 
399 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  33.82 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  36.11 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  35.39 
 
 
396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  33.65 
 
 
222 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  35.8 
 
 
397 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3657  MOSC domain containing protein  38.02 
 
 
221 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>